Será la novena participación de Peñarol en la Copa Sudamericana. En ninguna de ellas ha podido avanzar a los cuartos de final. A continuación, PadreyDecano hará un repaso de cada una de las ediciones desde el 2004 hasta la actualidad.

Copa Sudamericana 2004 – Eliminado en octavos de final

Danubio 1 VS. 2 (Carlos Bueno X2) Peñarol
Peñarol 1 (Carlos Bueno) VS. 1 Danubio

Peñarol 1 (José Serna) VS. 3 Cerro Porteño
Cerro Porteño 1 VS.  Peñarol 2 (Cristian Rodriguez y Carlos Diogo)

​Copa Sudamericana 2010 – Eliminado en octavos de final

Barcelona 0 VS. 1 (Mathias Aguirregaray) Peñarol
Peñarol 2 (Jonathan Ramis y Antonio Pacheco) VS. 1 Barcelona de Guayaquil

Goiás 1 VS. 0 Peñarol
Peñarol 3 (Mathias Corujo, Marcelo Sosa y Alejandro Martinuccio) VS. 2 Goiás

Eliminado por los goles de visitante

Copa Sudamericana 2013 – Eliminado en primera fase

Cobreloa 0 VS. 0 Peñarol
Peñarol 0 VS. 2 Cobreloa

Copa Sudamericana 2014 – Eliminado en octavos de final

Peñarol 2 (Jorge Rodríguez y Jonathan Rodríguez) VS. 0 Jorge Wilstermann
Jorge Wilstermann 0 VS. 4 (Diogo Silvestre, Jonathan Rodriguez, Juan Manuel Olivera y Damián Macaluso) Peñarol 

Peñarol 2 (Carlos Núñez y Marcelo Zalayeta) VS. Deportivo Cali
Deportivo Cali 0 VS. 1 (Marcelo Zalayeta) Peñarol

Estudiantes 2 VS. 1 (Fabián Estoyanoff) Peñarol
Peñarol 2 (Gonzalo Viera y Jonathan Rodriguez) VS. 1 Estudiantes

Eliminado por penales – 1-3.

Copa Sudamericana 2016 – Eliminado en primera fase

Sportivo Luqueño 0 VS. 0 Peñarol
Peñarol 1 (Matheus Bressan) VS. 1 Sportivo Luqueño

Eliminado por gol de visitante.

Copa Sudamericana 2018 – Eliminado en segunda fase

Athletico Paranaense 2 VS. 0 Peñarol
​Peñarol 1 (Cristian Rodríguez) VS. 4 Athletico Paranaense

Copa Sudamericana 2019 – Eliminado en segunda fase​

Deportivo Cali 1 VS. 1 (Gastón Rodríguez) Peñarol
​Peñarol 2 (Agustín Canobbio y Walter Gargano) VS. 0 Deportivo Cali

Peñarol 1 (Gastón Rodríguez) VS. 2 Fluminense
Fluminense 3 VS. 1 (Lucas Viatri) Peñarol

Copa Sudamericana 2020 – Eliminado en segunda fase

Vélez Sarsfield 0 VS. 0 Peñarol
Peñarol 1 (Cristian Rodríguez) VS. 1 Vélez Sarsfield

Eliminado por gol de visitante.

En números generales, Peñarol disputó 26 partidos por Copa Sudamericana, cosechando 10 victorias, 8 empates y 8 derrotas.